| CHRNA5 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | CHRNA5, LNCR2, cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 118505 MGI: 87889 HomoloGene: 55485 GeneCards: CHRNA5 |
|---|
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| pozanicline[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • acetylcholine receptor activity
• ion channel activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ligand-gated ion channel activity
• extracellular ligand-gated ion channel activity
• acetylcholine binding
• acetylcholine-gated cation-selective channel activity
• transmembrane signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• acetylcholine-gated channel complex
• postsynaptic membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• синапс
• міжклітинні контакти
• dopaminergic synapse
• integral component of plasma membrane
• neuron projection
|
|---|
| Біологічний процес | • response to nicotine
• synaptic transmission, cholinergic
• ion transport
• behavioral response to nicotine
• neuromuscular synaptic transmission
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• chemical synaptic transmission
• regulation of postsynaptic membrane potential
• excitatory postsynaptic potential
• ion transmembrane transport
• regulation of synaptic vesicle exocytosis
• regulation of membrane potential
• nervous system process
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | | NM_176844
NM_001373901
NM_001373902 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | | NP_789814
NP_001360830
NP_001360831 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 15: 78.57 – 78.6 Mb | Хр. 9: 54.89 – 54.92 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CHRNA5 (англ. Cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 53 054[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAARGSGPRA | | LRLLLLVQLV | | AGRCGLAGAA | | GGAQRGLSEP | | SSIAKHEDSL |
| LKDLFQDYER | | WVRPVEHLND | | KIKIKFGLAI | | SQLVDVDEKN | | QLMTTNVWLK |
| QEWIDVKLRW | | NPDDYGGIKV | | IRVPSDSVWT | | PDIVLFDNAD | | GRFEGTSTKT |
| VIRYNGTVTW | | TPPANYKSSC | | TIDVTFFPFD | | LQNCSMKFGS | | WTYDGSQVDI |
| ILEDQDVDKR | | DFFDNGEWEI | | VSATGSKGNR | | TDSCCWYPYV | | TYSFVIKRLP |
| LFYTLFLIIP | | CIGLSFLTVL | | VFYLPSNEGE | | KICLCTSVLV | | SLTVFLLVIE |
| EIIPSSSKVI | | PLIGEYLVFT | | MIFVTLSIMV | | TVFAINIHHR | | SSSTHNAMAP |
| LVRKIFLHTL | | PKLLCMRSHV | | DRYFTQKEET | | ESGSGPKSSR | | NTLEAALDSI |
| RYITRHIMKE | | NDVREVVEDW | | KFIAQVLDRM | | FLWTFLFVSI | | VGSLGLFVPV |
| IYKWANILIP | | VHIGNANK |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Chini B., Clementi F., Hukovic N., Sher E. (1992). Neuronal-type alpha-bungarotoxin receptors and the alpha 5-nicotinic receptor subunit gene are expressed in neuronal and nonneuronal human cell lines. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1572—1576. PMID 1542648 DOI:10.1073/pnas.89.5.1572
- Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chanock S.J., Hunter D.J. (2008). Genomics: when the smoke clears. Nature. 452: 537—538. PMID 18385720 DOI:10.1038/452537a
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1959 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P30532 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
