| GABRE |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | GABRE, gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit epsilon |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 300093 HomoloGene: 68425 GeneCards: GABRE |
|---|
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| picrotoxin[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • chloride channel activity
• extracellular ligand-gated ion channel activity
• GABA-gated chloride ion channel activity
• GABA-A receptor activity
• ion channel activity
• transmembrane signaling receptor activity
• inhibitory extracellular ligand-gated ion channel activity
• benzodiazepine receptor activity
• transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• міжклітинні контакти
• postsynaptic membrane
• клітинна мембрана
• синапс
• мембрана
• chloride channel complex
• GABA-A receptor complex
• integral component of plasma membrane
• dendrite membrane
• neuron projection
• postsynapse
|
|---|
| Біологічний процес | • ion transmembrane transport
• chloride transport
• chloride transmembrane transport
• ion transport
• negative regulation of chloride transport
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• gamma-aminobutyric acid signaling pathway
• chemical synaptic transmission
• regulation of membrane potential
• nervous system process
• synaptic transmission, GABAergic
• regulation of postsynaptic membrane potential
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_004961
NM_021984
NM_021987
NM_021990 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. X: 151.95 – 151.97 Mb | н/д |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GABRE (англ. Gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 506 амінокислот, а молекулярна маса — 57 972[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MLSKVLPVLL | | GILLILQSRV | | EGPQTESKNE | | ASSRDVVYGP | | QPQPLENQLL |
| SEETKSTETE | | TGSRVGKLPE | | ASRILNTILS | | NYDHKLRPGI | | GEKPTVVTVE |
| ISVNSLGPLS | | ILDMEYTIDI | | IFSQTWYDER | | LCYNDTFESL | | VLNGNVVSQL |
| WIPDTFFRNS | | KRTHEHEITM | | PNQMVRIYKD | | GKVLYTIRMT | | IDAGCSLHML |
| RFPMDSHSCP | | LSFSSFSYPE | | NEMIYKWENF | | KLEINEKNSW | | KLFQFDFTGV |
| SNKTEIITTP | | VGDFMVMTIF | | FNVSRRFGYV | | AFQNYVPSSV | | TTMLSWVSFW |
| IKTESAPART | | SLGITSVLTM | | TTLGTFSRKN | | FPRVSYITAL | | DFYIAICFVF |
| CFCALLEFAV | | LNFLIYNQTK | | AHASPKLRHP | | RINSRAHART | | RARSRACARQ |
| HQEAFVCQIV | | TTEGSDGEER | | PSCSAQQPPS | | PGSPEGPRSL | | CSKLACCEWC |
| KRFKKYFCMV | | PDCEGSTWQQ | | GRLCIHVYRL | | DNYSRVVFPV | | TFFFFNVLYW |
| LVCLNL |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Davies P.A., Hanna M.C., Hales T.G., Kirkness E.F. (1997). Insensitivity to anaesthetic agents conferred by a class of GABA(A) receptor subunit. Nature. 385: 820—823. PMID 9039914 DOI:10.1038/385820a0
- Wilke K., Gaul R., Klauck S.M., Poustka A. (1997). A gene in human chromosome band Xq28 (GABRE) defines a putative new subunit class of the GABAA neurotransmitter receptor. Genomics. 45: 1—10. PMID 9339354 DOI:10.1006/geno.1997.4885
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit epsilon переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4085 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P78334 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
