GRIA1

GRIA1
Ідентифікатори
Символи GRIA1, GLUH1, GLUR1, GLURA, GluA1, HBGR1, glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1, Glutamate receptor, ionotropic, AMPA 1
Зовнішні ІД OMIM: 138248 MGI: 95808 HomoloGene: 20226 GeneCards: GRIA1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Реагує на сполуку
AMPA, Анірацетам, cx516, CX546, Циклотіазид, IDRA-21, пірацетам, S-18986, GYKI 53655, GYKI-52,466, NBQX, Тезампанел, Аргіотоксин 636, Токсин Джоро, dasolampanel, Irampanel, selurampanel, zonampanel, топірамат[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

glutamate receptor activity
PDZ domain binding
AMPA glutamate receptor activity
ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
ionotropic glutamate receptor activity
extracellularly glutamate-gated ion channel activity
excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity
neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration
transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
amyloid-beta binding
signaling receptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
recycling endosome
endocytic vesicle membrane
postsynaptic membrane
cell projection
endoplasmic reticulum membrane
мембрана
Синаптичні бульбашки
GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
axonal spine
клітинна мембрана
dendritic spine
синапс
dendrite membrane
cell surface
міжклітинні контакти
neuronal cell body
дендрит (нейробіологія)
ендоплазматичний ретикулум
dendritic spine membrane
neuron spine
ER to Golgi transport vesicle membrane
neuron projection
AMPA glutamate receptor complex
ionotropic glutamate receptor complex
endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane
Golgi membrane
postsynapse
postsynaptic density membrane
ендосома
early endosome membrane
somatodendritic compartment
recycling endosome membrane
synaptic membrane
glutamatergic synapse
integral component of postsynaptic density membrane

Біологічний процес

receptor internalization
ion transport
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
ion transmembrane transport
COPII vesicle coating
довготривала пам'ять
GO:0015915 транспорт
Довготривале пригнічення
GO:0072468 сигнальна трансдукція
chemical synaptic transmission
ionotropic glutamate receptor signaling pathway
excitatory postsynaptic potential
regulation of postsynaptic membrane potential
regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration
chemical synaptic transmission, postsynaptic
regulation of NMDA receptor activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2890
14799
Ensembl
ENSG00000155511
ENSMUSG00000020524
UniProt
P42261
P23818
RefSeq (мРНК)
NM_000827
NM_001114183
NM_001258019
NM_001258020
NM_001258021
NM_001258022
NM_001258023
NM_001364165
NM_001364166
NM_001364167
NM_001113325
NM_001252403
NM_008165
RefSeq (білок)
NP_000818
NP_001107655
NP_001244948
NP_001244949
NP_001244950
NP_001244951
NP_001244952
NP_001351094
NP_001351095
NP_001351096
NP_001106796
NP_001239332
NP_032191
Локус (UCSC) Хр. 5: 153.49 – 153.81 Mb Хр. 11: 56.9 – 57.22 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GRIA1 (англ. Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 101 506[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLT
EPPKLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSF
CGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYD
ADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLV
VVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDLNKFKESGANV
TGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLT
GNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGD
NSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHV
GYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVRE
EVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGV
SVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESA
EDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTT
EEGMIRVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIAT
PKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSA
LSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSI
NEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
LGATGL

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, синапсах.

Література

  • Potier M.-C., Spillantini M.G., Carter N.P. (1992). The human glutamate receptor cDNA GluR1: cloning, sequencing, expression and localization to chromosome 5. DNA Seq. 2: 211—218. PMID 1320959 DOI:10.3109/10425179209020805
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з GRIA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4571 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
  6. UniProt, P42261 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Cys-петельні
Серотонін
ГАМК
  • ГАМКА
    • α1
    • α2
    • α3
    • α4
    • α5
    • α6
    • β1
    • β2
    • β3
    • γ1
    • γ2
    • γ3
    • δ
    • ε
    • π
    • θ
  • ГАМКА
    • ρ1
    • ρ2
    • ρ3
Гліцин
  • α1
  • α2
  • α3
  • α4
  • β
Нікотин ацетилхолін
  • пентамери: (α3)2(β4)3
  • (α4)2(β2)3
  • (α7)5
  • (α1)2(β4)3
  • (α1)2β1δε
Цинк
Іонотропні глутаматні
Тільки ліганд-залежні
Потенціал- та ліганд-залежні
Орфанні
  • GluD
    • δ1
    • δ2
АТФ-залежні
Пуринові рецептори