EFTUD2

EFTUD2
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

3JCR

معرفات
أسماء بديلة EFTUD2, MFDGA, MFDM, SNRNP116, Snrp116, Snu114, U5-116KD, elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 603892 MGI: MGI:1336880 HomoloGene: 3133 GeneCards: 9343
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• nucleotide binding
• GTP binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• ‏GO:0006184 GTPase activity
• RNA binding
• U5 snRNA binding

مكونات خلوية

• جسيم كاخال
• nuclear speck
• catalytic step 2 spliceosome
• spliceosomal complex
• غشاء
• نواة
• بلازم نووي
• ‏GO:0005578 نسيج بيني خارج الخلية
• عصارة خلوية
• U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
• U2-type catalytic step 2 spliceosome
• ribonucleoprotein complex
• U2-type precatalytic spliceosome

عمليات حيوية

• mRNA splicing, via spliceosome
• mRNA processing
• تضفير الآر أن إيه
• response to cocaine

المصادر:Amigo / QuickGO
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 9343 20624
Ensembl ENSG00000108883 ENSMUSG00000020929
يونيبروت

Q15029
K7EIT3

O08810

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001258353، ‏NM_001258354، ‏NM_004247، ‏XM_047437084 NM_001142605، ‏NM_001258353، ‏NM_001258354، ‏NM_004247، ‏XM_047437084

‏NM_011431، ‏XM_006532665 NM_001109995، ‏NM_011431، ‏XM_006532665

RefSeq (بروتين)

‏NP_001245282، ‏NP_001245283، ‏NP_004238 NP_001136077، ‏NP_001245282، ‏NP_001245283، ‏NP_004238

‏NP_035561، ‏XP_006532728 NP_001103465، ‏NP_035561، ‏XP_006532728

الموقع (UCSC n/a Chr 11: 102.73 – 102.77 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

EFTUD2‏ (Elongation factor Tu GTP binding domain containing 2) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين EFTUD2 في الإنسان.[1][2]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Fabrizio P، Laggerbauer B، Lauber J، Lane WS، Lührmann R (يوليو 1997). "An evolutionarily conserved U5 snRNP-specific protein is a GTP-binding factor closely related to the ribosomal translocase EF-2". The EMBO Journal. ج. 16 ع. 13: 4092–106. DOI:10.1093/emboj/16.13.4092. PMC:1170032. PMID:9233818.
  2. ^ "Entrez Gene: EFTUD2 elongation factor Tu GTP binding domain containing 2". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

  • Nomura N، Miyajima N، Sazuka T، Tanaka A، Kawarabayasi Y، Sato S، Nagase T، Seki N، Ishikawa K، Tabata S (1995). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1". DNA Research. ج. 1 ع. 1: 27–35. DOI:10.1093/dnares/1.1.27. PMID:7584026.
  • Nomura N، Miyajima N، Sazuka T، Tanaka A، Kawarabayasi Y، Sato S، Nagase T، Seki N، Ishikawa K، Tabata S (1995). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1 (supplement)". DNA Research. ج. 1 ع. 1: 47–56. DOI:10.1093/dnares/1.1.47. PMID:7584028.
  • Maruyama K، Sugano S (يناير 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. ج. 138 ع. 1–2: 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID:8125298.
  • Suzuki Y، Yoshitomo-Nakagawa K، Maruyama K، Suyama A، Sugano S (أكتوبر 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. ج. 200 ع. 1–2: 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID:9373149.
  • Achsel T، Ahrens K، Brahms H، Teigelkamp S، Lührmann R (نوفمبر 1998). "The human U5-220kD protein (hPrp8) forms a stable RNA-free complex with several U5-specific proteins, including an RNA unwindase, a homologue of ribosomal elongation factor EF-2, and a novel WD-40 protein". Molecular and Cellular Biology. ج. 18 ع. 11: 6756–66. DOI:10.1128/mcb.18.11.6756. PMC:109259. PMID:9774689.
  • Makarov EM، Makarova OV، Achsel T، Lührmann R (مايو 2000). "The human homologue of the yeast splicing factor prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions". Journal of Molecular Biology. ج. 298 ع. 4: 567–75. DOI:10.1006/jmbi.2000.3685. PMID:10788320.
  • Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، Grigorieff N، Moore MJ (أبريل 2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
  • Peng R، Dye BT، Pérez I، Barnard DC، Thompson AB، Patton JG (أكتوبر 2002). "PSF and p54nrb bind a conserved stem in U5 snRNA". RNA. ج. 8 ع. 10: 1334–47. DOI:10.1017/S1355838202022070. PMC:1370341. PMID:12403470.
  • Ajuh P، Chusainow J، Ryder U، Lamond AI (ديسمبر 2002). "A novel function for human factor C1 (HCF-1), a host protein required for herpes simplex virus infection, in pre-mRNA splicing". The EMBO Journal. ج. 21 ع. 23: 6590–602. DOI:10.1093/emboj/cdf652. PMC:136956. PMID:12456665.
  • Li J، Hawkins IC، Harvey CD، Jennings JL، Link AJ، Patton JG (نوفمبر 2003). "Regulation of alternative splicing by SRrp86 and its interacting proteins". Molecular and Cellular Biology. ج. 23 ع. 21: 7437–47. DOI:10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC:207616. PMID:14559993.
  • Will CL، Schneider C، Hossbach M، Urlaub H، Rauhut R، Elbashir S، Tuschl T، Lührmann R (يونيو 2004). "The human 18S U11/U12 snRNP contains a set of novel proteins not found in the U2-dependent spliceosome". RNA. ج. 10 ع. 6: 929–41. DOI:10.1261/rna.7320604. PMC:1370585. PMID:15146077.
  • Beausoleil SA، Jedrychowski M، Schwartz D، Elias JE، Villén J، Li J، Cohn MA، Cantley LC، Gygi SP (أغسطس 2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 101 ع. 33: 12130–5. DOI:10.1073/pnas.0404720101. PMC:514446. PMID:15302935.
  • Andersen JS، Lam YW، Leung AK، Ong SE، Lyon CE، Lamond AI، Mann M (يناير 2005). "Nucleolar proteome dynamics". Nature. ج. 433 ع. 7021: 77–83. DOI:10.1038/nature03207. PMID:15635413.
  • Lennerz V، Fatho M، Gentilini C، Frye RA، Lifke A، Ferel D، Wölfel C، Huber C، Wölfel T (نوفمبر 2005). "The response of autologous T cells to a human melanoma is dominated by mutated neoantigens". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 44: 16013–8. DOI:10.1073/pnas.0500090102. PMC:1266037. PMID:16247014.
  • Olsen JV، Blagoev B، Gnad F، Macek B، Kumar C، Mortensen P، Mann M (نوفمبر 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. ج. 127 ع. 3: 635–48. DOI:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID:17081983.
  • Koch HB، Zhang R، Verdoodt B، Bailey A، Zhang CD، Yates JR، Menssen A، Hermeking H (يناير 2007). "Large-scale identification of c-MYC-associated proteins using a combined TAP/MudPIT approach". Cell Cycle. ج. 6 ع. 2: 205–17. DOI:10.4161/cc.6.2.3742. PMID:17314511.
  • Ewing RM، Chu P، Elisma F، Li H، Taylor P، Climie S، McBroom-Cerajewski L، Robinson MD، O'Connor L، Li M، Taylor R، Dharsee M، Ho Y، Heilbut A، Moore L، Zhang S، Ornatsky O، Bukhman YV، Ethier M، Sheng Y، Vasilescu J، Abu-Farha M، Lambert JP، Duewel HS، Stewart II، Kuehl B، Hogue K، Colwill K، Gladwish K، Muskat B، Kinach R، Adams SL، Moran MF، Morin GB، Topaloglou T، Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. ج. 3 ع. 1: 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC:1847948. PMID:17353931.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 17
جينات الكروموسوم 17
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة طب
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية