SPOP

SPOP
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

2CR2, 3HQH, 3HQI, 3HQL, 3HQM, 3HTM, 3HU6, 3IVB, 3IVQ, 3IVV, 4EOZ, 4HS2, 4J8Z, 4O1V

معرفات
أسماء بديلة SPOP, BTBD32, TEF2, speckle type BTB/POZ protein, NEDMIDF, NSDVS1, NSDVS2, NEDMACE
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 602650 MGI: MGI:1343085 HomoloGene: 68354 GeneCards: 8405
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• ubiquitin protein ligase binding

مكونات خلوية

• Cul3-RING ubiquitin ligase complex
• nuclear speck
• نواة
• بلازم نووي
• سيتوبلازم
• SCF ubiquitin ligase complex

عمليات حيوية

• protein ubiquitination
• regulation of proteolysis
• ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• glucose homeostasis
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
• negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
• positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
• positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process
• ubiquitin-dependent protein catabolic process

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي


المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 8405 20747
Ensembl ENSG00000121067 ENSMUSG00000057522
يونيبروت

O43791
D6RFL7

Q6ZWS8

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001007227، ‏NM_001007228، ‏NM_001007229، ‏NM_001007230، ‏NM_003563، ‏XM_024450995، ‏NM_001370730، ‏NM_001370731، ‏NM_001370732 NM_001007226، ‏NM_001007227، ‏NM_001007228، ‏NM_001007229، ‏NM_001007230، ‏NM_003563، ‏XM_024450995، ‏NM_001370730، ‏NM_001370731، ‏NM_001370732

‏NM_001359107 NM_025287، ‏NM_001359107

RefSeq (بروتين)

‏NP_001007228، ‏NP_001007229، ‏NP_001007230، ‏NP_001007231، ‏NP_003554، ‏XP_024306763، ‏NP_001357659، ‏NP_001357660، ‏NP_001357661 NP_001007227، ‏NP_001007228، ‏NP_001007229، ‏NP_001007230، ‏NP_001007231، ‏NP_003554، ‏XP_024306763، ‏NP_001357659، ‏NP_001357660، ‏NP_001357661

‏NP_001346036 NP_079563، ‏NP_001346036

الموقع (UCSC n/a Chr 11: 95.3 – 95.38 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

SPOP‏ (Speckle-type POZ protein) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SPOP في الإنسان.[1][1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ ا ب "Entrez Gene: SPOP speckle-type POZ protein". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  2. ^ Nagai Y، Kojima T، Muro Y، Hachiya T، Nishizawa Y، Wakabayashi T، Hagiwara M (نوفمبر 1997). "Identification of a novel nuclear speckle-type protein, SPOP". FEBS Letters. ج. 418 ع. 1–2: 23–6. DOI:10.1016/S0014-5793(97)01340-9. PMID:9414087.
  3. ^ Zapata JM، Pawlowski K، Haas E، Ware CF، Godzik A، Reed JC (يونيو 2001). "A diverse family of proteins containing tumor necrosis factor receptor-associated factor domains". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 26: 24242–52. DOI:10.1074/jbc.M100354200. PMID:11279055.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)

قراءة متعمقة

  • Maruyama K، Sugano S (يناير 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. ج. 138 ع. 1–2: 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID:8125298.
  • Bonaldo MF، Lennon G، Soares MB (سبتمبر 1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Research. ج. 6 ع. 9: 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID:8889548.
  • Suzuki Y، Yoshitomo-Nakagawa K، Maruyama K، Suyama A، Sugano S (أكتوبر 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. ج. 200 ع. 1–2: 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID:9373149.
  • Wu J، Song Y، Bakker AB، Bauer S، Spies T، Lanier LL، Phillips JH (يوليو 1999). "An activating immunoreceptor complex formed by NKG2D and DAP10". Science. ج. 285 ع. 5428: 730–2. DOI:10.1126/science.285.5428.730. PMID:10426994.
  • Hartley JL، Temple GF، Brasch MA (نوفمبر 2000). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Research. ج. 10 ع. 11: 1788–95. DOI:10.1101/gr.143000. PMC:310948. PMID:11076863.
  • Zapata JM، Pawlowski K، Haas E، Ware CF، Godzik A، Reed JC (يونيو 2001). "A diverse family of proteins containing tumor necrosis factor receptor-associated factor domains". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 26: 24242–52. DOI:10.1074/jbc.M100354200. PMID:11279055.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Takahashi I، Kameoka Y، Hashimoto K (أغسطس 2002). "MacroH2A1.2 binds the nuclear protein Spop". Biochimica et Biophysica Acta. ج. 1591 ع. 1–3: 63–8. DOI:10.1016/S0167-4889(02)00249-5. PMID:12183056.
  • Gilfillan S، Ho EL، Cella M، Yokoyama WM، Colonna M (ديسمبر 2002). "NKG2D recruits two distinct adapters to trigger NK cell activation and costimulation". Nature Immunology. ج. 3 ع. 12: 1150–5. DOI:10.1038/ni857. PMID:12426564.
  • Diefenbach A، Tomasello E، Lucas M، Jamieson AM، Hsia JK، Vivier E، Raulet DH (ديسمبر 2002). "Selective associations with signaling proteins determine stimulatory versus costimulatory activity of NKG2D". Nature Immunology. ج. 3 ع. 12: 1142–9. DOI:10.1038/ni858. PMID:12426565.
  • Billadeau DD، Upshaw JL، Schoon RA، Dick CJ، Leibson PJ (يونيو 2003). "NKG2D-DAP10 triggers human NK cell-mediated killing via a Syk-independent regulatory pathway". Nature Immunology. ج. 4 ع. 6: 557–64. DOI:10.1038/ni929. PMID:12740575.
  • Liu A، Desai BM، Stoffers DA (مايو 2004). "Identification of PCIF1, a POZ domain protein that inhibits PDX-1 (MODY4) transcriptional activity". Molecular and Cellular Biology. ج. 24 ع. 10: 4372–83. DOI:10.1128/MCB.24.10.4372-4383.2004. PMC:400448. PMID:15121856.
  • La M، Kim K، Park J، Won J، Lee JH، Fu YM، Meadows GG، Joe CO (يوليو 2004). "Daxx-mediated transcriptional repression of MMP1 gene is reversed by SPOP". Biochemical and Biophysical Research Communications. ج. 320 ع. 3: 760–5. DOI:10.1016/j.bbrc.2004.06.022. PMID:15240113.
  • Wiemann S، Arlt D، Huber W، Wellenreuther R، Schleeger S، Mehrle A، Bechtel S، Sauermann M، Korf U، Pepperkok R، Sültmann H، Poustka A (أكتوبر 2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Research. ج. 14 ع. 10B: 2136–44. DOI:10.1101/gr.2576704. PMC:528930. PMID:15489336.
  • Hernández-Muñoz I، Lund AH، van der Stoop P، Boutsma E، Muijrers I، Verhoeven E، Nusinow DA، Panning B، Marahrens Y، van Lohuizen M (مايو 2005). "Stable X chromosome inactivation involves the PRC1 Polycomb complex and requires histone MACROH2A1 and the CULLIN3/SPOP ubiquitin E3 ligase". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 21: 7635–40. DOI:10.1073/pnas.0408918102. PMC:1140410. PMID:15897469.
  • Rual JF، Venkatesan K، Hao T، Hirozane-Kishikawa T، Dricot A، Li N، Berriz GF، Gibbons FD، Dreze M، Ayivi-Guedehoussou N، Klitgord N، Simon C، Boxem M، Milstein S، Rosenberg J، Goldberg DS، Zhang LV، Wong SL، Franklin G، Li S، Albala JS، Lim J، Fraughton C، Llamosas E، Cevik S، Bex C، Lamesch P، Sikorski RS، Vandenhaute J، Zoghbi HY، Smolyar A، Bosak S، Sequerra R، Doucette-Stamm L، Cusick ME، Hill DE، Roth FP، Vidal M (أكتوبر 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514.
  • Mehrle A، Rosenfelder H، Schupp I، del Val C، Arlt D، Hahne F، Bechtel S، Simpson J، Hofmann O، Hide W، Glatting KH، Huber W، Pepperkok R، Poustka A، Wiemann S (يناير 2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Research. ج. 34 ع. Database issue: D415-8. DOI:10.1093/nar/gkj139. PMC:1347501. PMID:16381901.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 17
جينات الكروموسوم 17
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية