LSM4

LSM4
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

3JCR

معرفات
أسماء بديلة LSM4, GRP, YER112W, homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607284 MGI: MGI:1354692 HomoloGene: 134555 GeneCards: 25804
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• U6 snRNA binding
• RNA binding
• PH domain binding

مكونات خلوية

• spliceosomal tri-snRNP complex
• U6 snRNP
• أجسام P
• بلازم نووي
• إسقاط عصبون
• spliceosomal complex
• نواة
• عصارة خلوية
• غشاء
• ‏GO:0009327 protein-containing complex
• U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
• U2-type precatalytic spliceosome
• Lsm2-8 complex

عمليات حيوية

• ‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 المعالجة
• mRNA processing
• spliceosomal snRNP assembly
• spliceosomal complex assembly
• P-body assembly
• exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA
• تضفير الآر أن إيه
• mRNA splicing, via spliceosome
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي


المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 25804 50783
Ensembl ENSG00000130520 ENSMUSG00000031848
يونيبروت

Q9Y4Z0

Q9QXA5

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001252129 NM_012321، ‏NM_001252129

‏NM_001359042، ‏XM_030243665 NM_015816، ‏NM_001359042، ‏XM_030243665

RefSeq (بروتين)

‏NP_036453 NP_001239058، ‏NP_036453

‏NP_001345971، ‏XP_030099525 NP_056631، ‏NP_001345971، ‏XP_030099525

الموقع (UCSC n/a Chr 8: 71.13 – 71.13 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

LSM4‏ (LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين LSM4 في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Salgado-Garrido J، Bragado-Nilsson E، Kandels-Lewis S، Seraphin B (أغسطس 1999). "Sm and Sm-like proteins assemble in two related complexes of deep evolutionary origin". EMBO J. ج. 18 ع. 12: 3451–62. DOI:10.1093/emboj/18.12.3451. PMC:1171424. PMID:10369684.
  2. ^ Achsel T، Brahms H، Kastner B، Bachi A، Wilm M، Luhrmann R (ديسمبر 1999). "A doughnut-shaped heteromer of human Sm-like proteins binds to the 3'-end of U6 snRNA, thereby facilitating U4/U6 duplex formation in vitro". EMBO J. ج. 18 ع. 20: 5789–802. DOI:10.1093/emboj/18.20.5789. PMC:1171645. PMID:10523320.
  3. ^ "Entrez Gene: LSM4 LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

  • Singer J، Roberts-Ems J، Luthardt FW، Riggs AD (1980). "Methylation of DNA in mouse early embryos, teratocarcinoma cells and adult tissues of mouse and rabbit". Nucleic Acids Res. ج. 7 ع. 8: 2369–85. DOI:10.1093/nar/7.8.2369. PMC:342390. PMID:523320.
  • Friesen WJ، Dreyfuss G (2000). "Specific sequences of the Sm and Sm-like (Lsm) proteins mediate their interaction with the spinal muscular atrophy disease gene product (SMN)". J. Biol. Chem. ج. 275 ع. 34: 26370–5. DOI:10.1074/jbc.M003299200. PMID:10851237.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Hu RM، Han ZG، Song HD، وآخرون (2000). "Gene expression profiling in the human hypothalamus-pituitary-adrenal axis and full-length cDNA cloning". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 97 ع. 17: 9543–8. DOI:10.1073/pnas.160270997. PMC:16901. PMID:10931946.
  • Eystathioy T، Peebles CL، Hamel JC، وآخرون (2002). "Autoantibody to hLSm4 and the heptameric LSm complex in anti-Sm sera". Arthritis Rheum. ج. 46 ع. 3: 726–34. DOI:10.1002/art.10220. PMID:11920408.
  • Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
  • Ingelfinger D، Arndt-Jovin DJ، Lührmann R، Achsel T (2003). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. ج. 8 ع. 12: 1489–501. DOI:10.1017/S1355838202021726. PMC:1370355. PMID:12515382.
  • Lehner B، Sanderson CM (2004). "A Protein Interaction Framework for Human mRNA Degradation". Genome Res. ج. 14 ع. 7: 1315–23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC:442147. PMID:15231747.
  • Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
  • Fürst J، Schedlbauer A، Gandini R، وآخرون (2005). "ICln159 folds into a pleckstrin homology domain-like structure. Interaction with kinases and the splicing factor LSm4". J. Biol. Chem. ج. 280 ع. 35: 31276–82. DOI:10.1074/jbc.M500541200. PMID:15905169.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Rual JF، Venkatesan K، Hao T، وآخرون (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514.
  • Yang ZQ، Streicher KL، Ray ME، وآخرون (2007). "Multiple interacting oncogenes on the 8p11-p12 amplicon in human breast cancer". Cancer Res. ج. 66 ع. 24: 11632–43. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-2946. PMID:17178857.
  • Ewing RM، Chu P، Elisma F، وآخرون (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. ج. 3 ع. 1: 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC:1847948. PMID:17353931.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 19
جينات الكروموسوم 19
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية